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融合基因的形成是当两个不同的正常基因融合在一起，它曾一度被认为主要限于特殊类型癌症的形成。但是，最近大规模的人类与癌症基因组测序报告证明事实并非如此，这些被检测到的基因都涉及令人担忧的各种恶性肿瘤，从腺癌到前列腺癌及表面上看似良性的位置。
两个同域基因组自行融合可能不会造成危险。但，如果两个不同的基因组跨越彼此之间并融合形成新的蛋白功能就会出乱子。确定一个融合基因是否产生全长蛋白功能来预测致瘤潜能或长瘤是个重要关键，它可设为靶标及治癌的疗效作用。不过，要核对并预测其融合基因的功能是一项冗长而乏味的任务，其中涉及数星期之久的实验室克隆和基因表达的研究。
其中一种既新又快速的方法便是在synaTate使用概率格局。使用此网上程序，就可以轻易地预测所有阅读框及新融合基因表达概率。此外，其假定的断点/融合点也很容易辨别。 了解有关SynaTate更多运作。使用SynaTate预测费城染色体功能域
BCR – ABL基因融合基因便是背后驱使慢性骨髓性白血病发（CML）的其中一个例子。在10000人之中，1-2人患有CML，并且出现在所有群体组。发现接近95％CML患者拥有该融合基因，9号染色体的ABL基因与22号染色体的BCR基因融合时就产生该融合基因。被称为费城染色体则含有22号改变染色体融合基因。
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