龙年 - 龙基因组可以告诉我们些什么呢
根据中国十二生肖, 2012年是中国农历龙年。外表与大蜥蜴相像的龙在华人传统观念里常被视为象征着权力、神奇与昌盛。从欧洲神话至印度宗教史诗及其他文化也可以发现其传说。
如果要序列龙的基因组确实是太天马行空了,当然也不可能。因为龙不是真实的动物,它只出现在故事书里头的传说而已。然而,假设龙与蜥蜴是一脉相承,那么通过首个爬行动物基组,我们就可以想像到龙的基因组了。
绿安禄蜥或更普遍的名称绿色蜥蜴是第首个被序测的非禽类爬行动物。约320万年前,第一个陆栖脊椎动物与其它动物发生进化而分歧成哺乳及爬行动物。接着爬行类动物继续进化并分歧成蜥蜴和鸟类。该鸟类及哺乳动物的对比分析结果于2011的8月发表。其结果发现显著的不寻常蜥蜴基因特征,并为进化之谜带来了一些新线索。
众所皆知变色蜥有良好色觉,其视觉范围包括在紫外线并可以区分邻近色和图案。变色蜥利用其优好的色觉选择脖子下拥有色泽鲜明皮瓣的伴侣。因此,变色蜥的系谱基因可影响其色觉。视蛋白则负责其高度变异性。
科学家变色蜥基因组里发现不少与色觉相关的罕见基因。此外,他们还发现变色蜥其中11个基因不是哺乳动物直系同源;但是,所有哺乳动物直系同源都拥有变色蜥的视蛋白。
通过SynaSearch™我们可确认哺乳动物其中缺乏的视蛋白基因,同时检测其他物种的同源。蜥蜴的松果体-第三只眼睛可侦测辐照度及温度。哺乳动物也有松果体,但对光线不敏感。因此可料想哺到乳动物是缺乏P-opsin的(松果体-独特的视蛋白)。
从synaSearch™结果可发除了已经发现的同类外,蜥蜴的P-opsin与鸡和青蛙是极度相似的。若要着重于研究爬虫类动物的进化;可通过SynaCompare ™ 和 SynaTate ™ 进行鸡和蜥蜴P-opsin基因对比。
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第一步骤
点击 这里, 在SynaTate™"提交查询"。
选择查询"蛋白质 - 蛋白质"。

点击提交。


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第二步骤
结果显示 NR – BLAST蛋白质数据库里的命中居冠的蜥蜴P-opsin基因。


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第三步骤
点击链接得分结果,9(pinopsin Gallus gallus)查看其排列。


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