MGRC庆兔年
中国民间传说里的玉兔在月球上除了为嫦娥作伴之外,还拿着玉杵跪地捣药,为嫦娥制药。
现今,我们 可以确定地说,兔子在医疗领域的参与并不限于民间传说。 近年来,科学家们开 始认识到这些可爱的动物对医学研究的重要性,尤其是免疫学研究。欧洲兔(Oryctolagus cuniculus)的首次基因组测序(深度:2X)和测序草图于2005年完成。随后于2009年4月,7X深度的基因组测序和较高质量的测序草图也被发表。兔子所患的多数疾病跟人类的疾病类似,而且兔子有能力迅速地产生大量拥有高度特异性的抗体以对付外来的病原体。这些原因使它们成为研究人类自身免疫性疾病的的重要模型。
其中一个以兔子为研究模型的例子疾病是系统性红斑狼疮(SLE)。系统性红斑狼疮是一种人类和兔子都会患上的自身免疫性疾病。系统性红斑狼疮会令免疫过度反应,而攻击健康的细胞和组织,有时甚至导致病人的死亡。迄今为止,系统性红斑狼疮的起因仍然不明,也没有治疗方法。
然而,在过去的十年里,科学家研究治疗系统性红斑狼疮的努力有良好的进展,尤其针对集中和消除B细胞。B细胞被B细胞激活因子(BAFF)引发,并产生抗体以解决组织的损害。科学家们利用兔子SLE模型以更了解B细胞激活因子及其受体的功能。为此,以确保研究的相关性,比较人类和兔子的B细胞激活因子的同源序列是必要的。
通过SynaTate™,研究人员可以找出序列内的推定地区重要性。在这个例子中,我们利用兔子BAFF查询NR数据库,揭示了在第一正向阅读框突出的一个重要区域。选择此区域以在SwissProt数据库内利用SynaSearch™搜索序列。结果显示兔子BAFF最接近的匹配是人类肿瘤坏死因子配体超家族的成员-TNFSF13B蛋白质。正如所料,TNFSF13B的功能包括刺激人类免疫系统的B-和T-细胞。有了这些知识,研究人员将可以设计基因抑制或基因敲除的兔子研究模型,以进一步研究利用降低TNFSF13B蛋白质来治疗系统性红斑狼疮疾病的可能性。
随着研究人员发现越来越多人类基因和兔子基因之间的相关性,预计兔子模型将在发展疾病的生物医学研究和其治疗方法与疫苗占有重要意义。
第一步骤
找出兔子B细胞激活因子序列内的推定地区重要性:
点击 , 然后点此 .


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第二步骤
结果显示第一正向阅读框突出的一个重要区域。点击然后拖动以选择此区域。右击选择"搜索核苷酸序列"。


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第三步骤
在synaSearch™页面内,选择“核苷酸-蛋白质”查询类型和 "SwissProt UPKB"SynaBase目标数据库。点击"提交查询"。


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第四步骤
产生明显序列比对的第一序列是人类肿瘤坏死因子配体超家族的成员-TNFSF13B蛋白质。点击选择比对得分以显示序列比对。


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第五步骤
序列比对显示正值和比对模式开始及结束的位置。


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